Yazar "Doğanlar, Zeynep Banu" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 11 / 11
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Ağır metal miks uygulanan vasküler düz kas hücrelerinde antioksidan sistem ve apoptoz yolağı arasındaki moleküler etkileşimler(Trakya Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, 2019) Yavuz, Emrah; Doğanlar, Zeynep BanuAğır metaller en yaygın kirletici maddeler olup, özgül ağırlıkları 5 g cm-3 den fazla olan maddelerdir. İnsanların ağır metallere maruziyeti en fazla ağır metal içeren yiyecek ve suların tüketimi ile olmaktadır. İçme suyu ile alınan metaller vücutta genotoksisite ve çeşitli hastalıklara neden olabilmektedir. Bu nedenle insani tüketim amaçlı kullanılan sularda izin verilen ağır metal limitleri yasa ve yönetmeliklerle belirlenmiştir. Çalışmamızda insan sağlıklı aorta düz kas hücrelerinde (TG-HA-VSMC) içme sularında izin verilen limitlerde metal karıGımı (Cu, Zn, Pb ve Fe) uygulamalarının etkilerinin moleküler düzeyde belirlenmesi amaçlandı. Bu amaçla hücrelere içme sularında izin verilen konsantrasyon ve 10 kat yüksek konsantrasyonda metal karışımı 24 ve 48 saat süre ile uygulandı ve antioksidan enzimler, ısı şok proteinleri ve apoptoz yolak genlerinin ifadeleri ile DNA polimorfizmi belirlendi. Çalışma sonucunda ağır metal karışımına maruz kalan hücrelerde DNA polimorfizminin arttığı, antioksidan enzim gen ifadelerinin ve apoptotik hücre oranı ile birlikte apoptoz yolak genlerinin ifadelerinde artışın olduğu saptandı. Sonuç olarak, içme sularında izin verilen limitlerde ağır metal karışımının aorta düz kas hücrelerinde oksidatif stres, genotoksisite ve apoptoza neden olduğu belirlendi. Vasküler düz kas hücrelerinde apoptozun arteroskleroz, hipertansiyon gibi hastalıkların patofizyolojisinde rol oynadığı göz önünde bulundurulduğunda bu limitlerin daha kapsamlı çalışmalarda araştırılarak değerlendirilmesi gerektiği düşünüldü.Öğe Blood transcriptional signatures of gallstone pathogenesis in patients with cholelithiasis and choledocholithiasis(2022) Albayrak, Doğan; Doğanlar, Oğuzhan; Kahya, Eyüp; Doğan, Ayten; Doğanlar, Zeynep BanuAim: Disease-specific molecular signalling in peripheral blood has the potential to inform on pathophysiological mechanisms of diseases. Here, we aimed to investigate the blood-based gene expression profiles that reflect disease-specific pathogenic mechanisms of gallstones, such as antioxidant defence, heat-shock responses, DNA damage and repair, ABC pump mechanisms, mucin signals, mitochondrial dysfunction and apoptosis in patients with Cholelithiasis (CHL) and Choledocholithiasis (CHDL). Materials and Methods: The relative fold-change in the mRNA expression levels of 73 genes were analysed using a gallstone-related qRT-PCR array in 10 control individuals, 24 CHL patients and 23 CHDL patients. Serum malondialdehyde levels was determined by thiobarbituric-acid reactive substance assays, and 8-hydroxy-2’-deoxyguanosine levels was determined by ELISA assays. Results: Our results showed that peripheral whole blood gene expression profile strongly reflects tissue specific molecular signalling in gallstone pathogenesis. The present findings of altered gene expressions including antioxidant defence (CuZn-SOD, CAT), heat shock protein (HSP70), DNA repair (MLH1 and RAD18), pro-apoptotic (P53, BAX, Cytc and Caspase 3), ABC transporter (ABCB1, ABCC2, and LRP1) and Mucin signals (MUCIN4, MUCIN5AC and MUCIN5B) point out to DNA damages via oxidative stress as well as deteriorating ABC types pump mechanisms and mucin signals in CHL and CHDL patients. Our findings may also suggest that activation of mitophagy activator, DRP1/hFIS1/PINK1 axis induced by oxidative stress and DNA damage may have a role in the pathogenesis of CHL and CHDL. Conclusion: Our results indicate that a blood-based gene expression signature has promising accuracy for monitorize pathogenesis of disease in CHL patients, CHDL patients and unaffected controls.Öğe Combined treatment of cisplatin and 5-Fluorouracil Induces cell death in ARPE-19 cells through the endoplasmic reticulum stress pathway(2021) Doğan, Ayten; Doğanlar, Zeynep Banu; Doğanlar, OğuzhanAim: Cisplatin and 5-Fluorouracil have been used for about 50 years as chemotherapy agents. Combination of these two agents is known as PF therapy and is widely used in the treatment of anal, esophageal cancer, head and neck cancer. One of the problems encountered with antineoplastic agents is the rapid and irreversible side effects on non-target cells and organs. It is common that occourence of ocular toxicity by chemotherapy. Materials and Methods: ARPE-19 cell viability and toxicity were determined by performing (MTT)-based colorimetric assays and IC50 values calculated by probit analyses options of SPSS 20 Software. Acridine orange/Ethidium bromide (AO/EB) fluorescent staining was performed to determine structural changes such as cell blebbing and chromatin condensation during the apoptosis process on cells. Images examined under a fluorescent microscope (Zeiss Axio Vert.A1) at 40X magnification with FITC filter for AO and Tex Red filter. And Real-time PCR was performed with ABI Step One Plus and Quant Studio 5 Real-Time PCR systems.Results: PF treatment within 24 hours and 48 hours caused ER stress due to toxic effect and this induced cell death through apoptosis via death receptor signaling and intrinsic pathway in ARPE-19 cells. Conclusion: PF-induced activation of the ER stress mechanism can be used as a novel therapeutic strategy for the prevention of side effects of non-target cells.Öğe Distinguishing Non-Arteritic Ischemic Optic Neuropathy from optic Neuritis with Serum Vitamin B12, Ferritin and Folic Acid Level(2018) Güçlü, Hande; Doğanlar, Zeynep BanuObjectives: The aim of this study was to compare the levels of vitamin B12 (Vit B12), folic acid, serum ferritin, serumiron, and total iron binding capacity (TIBC) in patients with optic neuritis (ON) and non-arteritic ischemic optic neuropathy(NAION). It was hoped to determine whether these simple and inexpensive laboratory measurements are indicativefor making a distinction between ON and NAION.Methods: In this retrospective study, the data of patients who were diagnosed with ON and NAION between September2005 and December 2016 were reviewed. In all, 42 patients with NAION, 70 patients with ON, and 76 membersof a control group, a total of 188, were enrolled in the study. All of the participants underwent a full ophthalmologicalexamination and complete physical examination, including a detailed medical history and blood count and evaluation ofthe biochemical parameters, serum ferritin, Vit B12, folic acid, serum iron, and TIBC.Results: The mean serum ferritin level was 236±458.4 ng/mL for the NAION patients, 32.8±34.6 ng/mL for the ONpatients, and 76.1±84.6 ng/mL for the control group. The mean serum Vit B12 level was 478±306.3 pg/mL for the NAIONpatients, 291.7±136.9 pg/mL for the ON patients, and 417.1±163.4 pg/mL for the control group. The mean serum folicacid level was 11.4±6.3 ng/mL for the NAION patients, 6.6±2.7 ng/mL for the ON patients, and 14.5±5.2 ng/mL for thecontrol group.Conclusion: A higher serum ferritin level was significantly associated with NAION, and lower Vit B12 and folic acid wasassociated with ON patients. Serum ferritin, Vit B12, and folic acid measurements could be a useful method for distinguishingbetween NAION and ON before using complicated and invasive methodsÖğe The Effect of 5-Fu and Ruxolitinib on Mitochondrial Apoptosis in Glioblastoma U87 Cell Line(Trakya Üniversitesi, 2020) Aksu, Gonca; Doğanlar, Oğuzhan; Doğanlar, Zeynep BanuAims: The aim of this study is to carry out the effect of 5-Fluorouracil alone or combined with Ruxolitinib on both apoptosis and JAK/STAT pathway in U87 glioblastoma cells. Methods: We used U87 glioblastoma cell lines as the human brain cancer cells. We treated the cells with 5-Fluorouracil (3.125 ?M-400 ?M) alone and with a combination of Ruxolitinib (100 ?M or 400 ?M of Ruxolitinib with 3.125-25 ?M 5-Fluorouracil), and performed the MTT test for calculating IC50 value. Molecular fluorescence staining was performed with Hoechst and acridine orange/ethidium bromide probes. The alteration in mitochondrial apoptosis and JAK/STAT pathways to drug treatment was analyzed by the qRT-PCR assay. Results: Decrease in cell viability was more prominent in U87 cells treated with a combination of 5-Fluorouracil and Ruxolitinib compared to those treated with 5-Fluoro- uracil alone. In gene expression analysis, apoptosis signals were observed in cells treated with 5-Fluorouracil alone and 5-Fluo- rouracil+Ruxolitinib treatment. Conclusion: Treatment with 5-Fluorouracil alone and 5-Fluorouracil+Ruxolitinib combination increased apoptosis in U87 glioblastoma cells. However, it is difficult to mention an evident difference between treatments. Therefore, further studies are needed.Öğe FARKLI REKLAM İÇERİĞİNE MARUZ KALAN DENEKLERİN İŞLEVSEL, BİLİŞSEL VE GENETİK YANITLARI ÜZERİNDEN REKLAM ETKİNLİĞİNİN ANALİZİ(2020) Akyol, Ayşe; Doğanlar, Oğuzhan; Karadağ, Çetin Hakan; Doğanlar, Zeynep Banu; Akdoğan, ÇağatayReklam harcamalarının yıllık yarım trilyon doları aşması, reklam etkinliği konusunda yapılançalışmaların önemini de artırmaktadır. Reklam etkinliği ile ilgili yapılan araştırmalarincelendiğinde kan dokusu ve genetik üzerine bir çalışmanın yapılmadığı görülmekteve bu durum çalışmanın çıkış noktasını oluşturmaktadır. Söz konusu çalışmada reklametkinliği laboratuvar deneylerinden elde edilecek genetik yanıtlar ile değerlendirilerek,moleküler temelli biyolojik bir metodun geliştirilmesi amaçlanmıştır. Pozitif kontrol vedeney gruplarına yaklaşık 80 dakikalık bir film izletilmiş, ayrıca deney gruplarına filmarasında 90 saniyelik bir reklam filmi izletilmiştir. Genetik yanıtlar için katılımcılardanfilm öncesinde ve reklamın gösteriminden 2 saat sonra kan örnekleri alınmış, bu kanlarRibo Nükleik Asit (RNA) izolasyonu yapılarak Complementary Deoksiribo Nükleik Asit(cDNA) elde edilmiştir. Sonrasında her bir katılımcının gen ekspresyon değerleri hesaplanmıştır.Yapılan analizler sonucunda araştırmada kullanılan genlerin, reklamı seyredenve seyretmeyen grupları birbirinden ayırabildiği gibi, iki farklı reklamı seyreden gruplarıda birbirinden ayırabildiği görülmektedir.Öğe Genotoxic and Apoptotic Effects of Heavy Metal Mixture on Human Aortic Vascular Smooth Muscle Cell Line(2019) Yavuz, Emrah; Doğanlar, Zeynep BanuObjective: Heavy metals are the most common pollutantswith specific gravity greater than 5g cm-3. Human exposureto heavy metals occurs mostly through the consumption offood and water containing heavy metals. Metals that enter thebody via drinking water may cause genotoxicity and variousdiseases. Therefore, permissible limits of heavy metals inwater for human consumption have been determined by lawsand regulations. Our study aimed to investigate the effectsof a mix of metals (Cu, Zn, Pb and Fe) at permissible limitsin drinking water on aortic smooth muscle cells (TG-HAVSMC)with at molecular level.Material-Method: A metal mix at the permissible concentrationfor drinking water and 10-fold higher concentration wereexposed to human aortic smooth muscle for 24 and 48 hours, andgene expression of antioxidant enzymes (CuZn-SOD, Mn-SOD,CAT, GST), heat-shock proteins (HSP27, HSP60, HSP70) andapoptosis pathway (p53, PUMA, BCL2, BAX, Cyt-C, Casp-3,TNF-?, Casp-8, DR4, DR5) cell cycle control (p21) and DNArepair (EXO1) were investigated in addition to RAPD-DNApolymorphism.Results: It was determined that heavy metal exposure causedincrease in the DNA polymorphism, apoptotic cell ratios andenhanced antioxidant and apoptosis pathway gene expressionin cells.Conclusions: In conclusion, the mix consisting of heavy metalsat permissible limits in drinking water has been shown to causeoxidative stress, genotoxicity and apoptosis in human aorticsmooth muscle cells. Considering that apoptosis in vascularsmooth muscle cells plays a role in the pathophysiology ofdiseases such as arteriosclerosis and hypertension, we believeit would be beneficial to assess these limits through extensiveinvestigations in further studies.Öğe Is there a difference in 25-hydroxyvitamin D levels between female university students with and without joint hypermobility?(2019) Tuna, Filiz; Özdemir, Hande; Kabayel, Demirbağ Derya; Doğanlar, Zeynep BanuObjectives: Individuals with joint hypermobility (JH) constitute a sensitive group with regard tomusculoskeletal problems. This study aimed to investigate whether females with generalized jointhypermobility (GJH) are at risk of hypovitaminosis D compared with non-GJH female participants and whetherthere is a relationship between vitamin D levels, Beighton score and musculoskeletal complaints.Methods: In this cross-sectional, descriptive and case-control study, 76 female participants aged 18-25 yearswere included. The Beighton score with a cut-off of 4/9 was applied for defining GJH. In addition, serumbiochemical (the enzymatic colorimetric method) and hormonal (the electrochemiluminescence method)parameters were evaluated.Results: The mean serum 25-hydroxyvitamin D (25[OH]D) levels of GJH (n = 38) and non-GJH (n = 38)groups were 15.70 ± 7.96 ng/mL and 16.80 ± 5.45 ng/mL, respectively. There was no statistically significantdifference between the groups in terms of biochemical and hormonal parameters. We found vitamin Ddeficiency in 89.5% of participants with GJH, and 84.2% of controls. There was no correlation between vitaminD, Brighton criteria, and musculoskeletal complaints.Conclusion: The female participants with GJH showed similar frequency of musculoskeletal complaints andsimilar low level of 25(OH)D in relation to controls.Öğe Meriç Delta Balıklarında Çevre Kirliliğinin Genotoksik Etkileri: Antioksidan Savunma, Isı Şok Protein Sinyali ve DNA Hasar-Onarım Mekanizmaları(2020) Tokatlı, Cem; Doğanlar, Oğuzhan; Doğanlar, Zeynep BanuÇalışmamızda, Gala ve Sığırcı Gölleri için ekonomik açıdan önemli olan balıktürleri (Carassius gibelio (Bloch, 1782), Carassius carassius (Linnaeus, 1758),Scardinius erythrophthalmus (Linnaeus, 1758), Cyprinus carpio Linnaeus, 1758,Sander lucioperca (Linnaeus, 1758), Perca fluviatilis Linnaeus, 1758) üzerindekirliliğin etkileri araştırılmıştır. Kirliliğin genotoksik etkileri, kas, solungaç vekaraciğer dokularında antioksidan savunma sinyali (GS, Cu-Zn SOD, CAT), ısışok proteinleri (HSP26, HSP60, HSP70 ve HSP83) ve QRT-PCR testi ile DNAonarımı (SMUG1) metotları kullanılarak incelenmiştir. Ayrıca, RAPD analizikullanılarak balık dokularındaki DNA hasarları belirlenmiştir. Bant değişimleri,özellikle tüm balıkların solungaç dokularında açıkça tespit edilmiştir. Ayrıca,C. gibellio, S. erythrophthalmus ve S. lucioperca'nın kas dokusunda CuZnSOD'unnispi ekspresyonunda önemli bir artış gösterdiği tespit edilmiştir. CATekspresyonu tüm balık dokularında önemli ölçüde değişiklik sergilemiştir.Bununla birlikte, CAT 128,9, 102,1 ve 138,4 fg/ug total RNA'nın ekspresyonseviyesindeki en yüksek artış, S. lucioperca'nın kas, karaciğer ve solungaçdokularında belirlenmiştir. HSP60 ve HSP70 çevre kirliliğinden en azetkilenirken, S. lucioperca'nın karaciğer dokusunda en büyük DNA onarımaktivitesi açık şekilde gözlenmiştir. Çalışmamızın sonucunda, Gala ve SığırcıGöllerindeki çevre kirliliğinin DNA stabilitesi ve savunma sinyallerinin genifadeleri üzerinde genotoksik etkileri olduğu ortaya konulmuştur. Ayrıca,S. lucioperca türünün, su kirliliğinin biyolojik olarak izlenmesinde biyoindikatörbir tür olarak kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.Öğe Normal ve yüksek glukoz ile indüklenmiş diyabetik retinal pigment epitel (arpe-19) hücrelerinde gemsitabin ve 5-fu kombinasyonunun oksidatif stres ve mitokondriyal apoptoz yolağı üzerine etkisi(Sağlık Bilimleri, 2021) Ok, Esma Seben; Doğanlar, Zeynep BanuDiyabetik retinopati, erişkinlerde diyabetin önemli bir komplikasyonu olarak görme kaybının önde gelen nedenidir. Retina, kan-retina bariyeri olarak görme fonksiyonunun devamlılığını sağlamaktadır. Diyabetik hastalarda, retinanın uzun süre hiperglisemik ortama maruziyeti retinaya hasar vermektedir. Retina pigment epitel hücrelerinde meydana gelen hasar hücre kaybına, retinal dejenerasyona ve körlüğe neden olabilmektedir. 5-Florourasil+Gemsitabin kombinasyon tedavisi baş, boyun, meme gibi çeşitli kanser türlerinin tedavisinde kullanılmaktadır. 5-Florourasil, DNA ve RNA’ya, Gemsitabin ise DNA zincirine dahil olarak makromoleküllerin fonksiyonlarını bozmaktadır. Böylelikle 5-Florourasil+Gemsitabin, DNA zincirinin sentezlenmesine ve uzamasına hasar vermektedir. Çeşitli kanser türlerinde kullanılan 5-Florourasil+Gemsitabin kombine tedavisinin retinal pigment epitel hücrelerinde önemli hücresel sinyal yolaklarına etkisi belirlenmemiştir. Bu çalışmada, 5-Florourasil ve Gemsitabin kombinasyonunun normal ve diyabetik insan retinal pigment epitel (ARPE-19) hücrelerinde hücre canlılığı, yara iyileşmesi, DNA hasarı, oksidatif stres ve apoptoz üzerindeki etkilerinin belirlenmesi ve normal ve diyabetik hücrelerin kemoterapi ilaçlarına verdikleri hücresel ve moleküler tepkilerin karşılaştırılması amaçlandı. 5-Florourasil ve Gemsitabin kombinasyonunun normal ve diyabetik ARPE-19 hücrelerindeki hücre canlılığına olan etkileri MTT ve Tali görüntü temelli sitometre ile, genomik kalıp kararlılığına olan etkileri rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA analizi ile belirlendi. Ayrıca DNA hasar yanıtı EXO1 ve NEIL genlerinin ifadesi ile, oksidatif stres tepkisi reaktif oksijen türlerinin CM-H2-DCFDA moleküler floresan boyaması ve antioksidan 93 enzimlerin gen ifadeleri ile, hücresel apoptoz yolağındaki gen/protein ifadeleri ve floresan mikroskobik boyama ile belirlendi. Çalışma sonuçlarına göre, 5-Florourasil+Gemsitabin uygulamasının diyabetik hücrelerde IC50 değerinin daha düşük konsantrasyonda olduğu belirlendi. Kombine kemoterapi uygulamasının diyabetik hücrelerde yüksek DNA hasarı ile genomik kalıp kararlılığının daha düşük olmasına ve DNA tamir genlerinin daha yüksek ifade olmasına neden olduğu saptandı. Buna ilaveten hem normal hem diyabetik hücrelerde artan reaktif oksijen türlerinin düzeyi ile oksidatif stres meydana geldiği ve diyabetik hücrelerde antioksidan enzimlerin gen ifadelerinde daha belirgin artış olduğu belirlendi. Kemoterapi toksisitesinin hücrelerde içsel ve dışsal apoptoz yolağını aktive ettiği ve diyabetik hücrelerde apoptozun daha yüksek olduğu saptandı. Retinal pigment epitel hücrelerinin görme için birçok vital ve koruyucu rolü vardır. Bu nedenle bu hücrelerde uzun süreli hiperglisemik ortam ve kemoterapi sitotoksisitesi sonucu meydana gelen hasar görme bozukluklarına neden olabilmektedir. Çalışmamızda 5-Florourasil ve Gemsitabin uygulamasının hem hücresel hem de moleküler düzeyde sitotoksik ve genotoksik etkilerinin diyabetik hücrelerde daha belirgin olması nedeni ile diyabetik hastalarda bu yan etkilerin göz önünde bulundurulması gerektiği düşünüldü.Öğe Prostat Kanser Kök Hücrelerinin Apoptozu, Proliferasyonu ve Anti-neoplastik Tedavilerinde Midkin Büyüme Faktörünün Etkinliğinin Araştırılması(2018) Erdoğan, Suat; Öktem, Gülperi; Doğanlar, Oğuzhan; Dıbırdık, Ilker; Bilir, Ayhan; Doğanlar, Zeynep BanuProstat kanseri (PCa), özellikle gelişmiş ülkelerde erkeklerde yaygın görülen malignitedir ve kanserle ilişkili mortalitenin ikinci en sık nedenini oluşturur. Bu çalışmada midkin (MK) büyüme faktörünün PCa ve bunların kanser kök hücrelerinin (KKH) sağkalımı ve migrasyonuna etkinliği, kemoterapi ilaç tedavisine yanıtları ve seçilmiş doğal flavonoid bileşiklerin kemoterapi ilaçları ile kombinasyonlarının anti-kanser potansiyeli analiz edildi. Kanser kök hücreleri manyetik aktive edilmiş hücre izolasyon sistemi ile androjen-dirençli PC3 ve androjen-duyarlı LNCaP hücrelerinden ayrıştırıldı. Midkin proteinin rolü MK-spesifik siRNA transfeksiyonu ile mRNA sessizleştirilen (knock down) hücrelerde belirlendi. Hücrelere tedavi amaçlı farklı konsantrasyon ve sürelerde MK siRNA, enzalutamid, dozetaksel ve flavonoidler ayrı ayrı ve bunların formülasyonları kullanıldı. Analizlerde hücrelerin sağkalımı MTT testi, apoptoz ve hücre siklusu fazları sitometrik, protein modifikasyonları Western blot, mRNA ifade analizleri RT-qPCR, migrasyon ise yara iyileşmesi ve transwel deneyleri ile incelendi. Apoptozun hücresel düzeyde analizinde Hoechst boyası kullanıldı, tedavi sonrası hücrelerin ultrastruktürel değişimleri geçirimli elektron mikroskopisi ile değerlendirildi. Midkinin sessizleştirilmesi PC3, LNCAP ve bunlardan izole edilen kanser kök hücrelerinde hücre sağkalımını % 20 ? 25 düzeyinde azalttı ve hücre migrasyonunu baskıladı. Kullanılan dört farklı flavonoid bileşikten apigenin düşük konsantrasyonları ve kuersetin hücrelerde apoptozu uyarırken hücre döngüsünü G1 fazında tutarak proliferasyonu ve hücre migrasyonunu baskıladı. Midkin protein ifadesinin inhibisyonu ile birlikte uygulanan kemoterapi, tedavi gücünü belirgin düzeyde güçlendirdi ve hücre migrasyonunu inhibe etti. Bu tedaviye flavonoid eklenmesi androjen-duyarlı hücrelerde sitotoksik etkiyi önemli düzeyde yükseltti. Birleşik tedavi PI3K, AKT ve ERK1/2'nin fosforilasyonunu inhibe etti ve p38, ABCG2 ve NF-?B'nin protein ifadesini azalttı. Elde edilen verilere göre, MK, PCa ve KKH'lerin proliferasyonunda önemli rol oynamaktadır. Kemoterapi yanısıra flavonoid kullanımı ve midkin aracılı tedavi hastalığın relapsı, hücre göçü ve ilaç direncinde rol oynayan kanser kök hücrelerinin hedeflenmesinde önemli bir stratejiyi oluşturabilir.
