Distinctive Sire1 Retrotransposon Patterns on Barley Chromosomes?

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorKarlık, Elif
dc.contributor.authorGozukirmizi, Nermin
dc.date.accessioned2021-11-20T10:38:53Z
dc.date.available2021-11-20T10:38:53Z
dc.date.issued2021
dc.departmentTrakya Üniversitesien_US
dc.description.abstractSIRE1, Tyl/Copia Uzun Uç Tekrarlı (Long Terminal Repeats- LTR) retrotranspozon üst ailesine ait olan aktif, nispeten yüksek kopyalı bir retroementtir. Arpa genomundaki ayırt edici SIRE1 elementlerinin (ENV ve GAG) dağılımları floresan in situ hibridizasyonu (FISH) kullanılarak gözlemlendi. Tetramethylrhodamine-dUTP (TRITC)-işaretli probların elde edilmesinde PCR gerçekleştirildi. SIRE1 ENV ve GAG domainlerinin yerleşimleri, Hordeum vulgare L. cv. Hasat kök preparatlarında konfokal mikroskobu altında gösterildi. Sonuçlarımız, arpa genomundaki SIRE1 elementlerinin ENV ve GAG dağılımlarını göstermektedir. Bu sonuçlar, SIRE1 elementlerinin arpa genomunun organizasyonunun ortaya çıkarılmasına katkı sağlayacaktır. en_US
dc.description.abstractSIRE1 is an active and relatively high copy-number retroelement belongs to the Tyl/Copia long terminal repeat (LTR) retrotransposon superfamily. Distinctive SIRE1 elements (ENV and GAG) distributions in barley genome were observed by using fluorescent in situ hybridization (FISH). We performed PCR to obtain tetramethylrhodamine-dUTP (TRITC)-labelled probes. Localizations of SIRE1 ENV and GAG domains were demonstrated under confocal microscope on Hordeum vulgare L. cv. Hasat root preparations. Our results revealed the distributions of SIRE1 elements ENV and GAG in barley genome. These results may provide to uncover the organization of SIRE retrotransposon pattern in barley genome.en_US
dc.identifier.dergipark773302en_US
dc.identifier.doi10.23902/trkjnat.773302en_US
dc.identifier.endpage15en_US
dc.identifier.issn2147-0294
dc.identifier.issn2528-9691
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage9en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.23902/trkjnat.773302
dc.identifier.urihttps://dergipark.org.tr/tr/pub/trkjnat/issue/61393/773302
dc.identifier.urihttps://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/1214325
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14551/7544
dc.identifier.volume22en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisherTrakya Üniversitesien_US
dc.relation.ispartofTrakya University Journal of Natural Sciencesen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Başka Kurum Yazarıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.snmz20240608_ID_Qen_US
dc.subjectFluorescence in situ hybridizationen_US
dc.subjectRetrotransposonen_US
dc.subjectSIRE1en_US
dc.subjectBarleyen_US
dc.subjectENVen_US
dc.subjectGAGen_US
dc.titleDistinctive Sire1 Retrotransposon Patterns on Barley Chromosomes?en_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
7544.pdf
Boyut:
854.45 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

Trakya University Journal of Natural Sciences
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu