İshalli hastalarda patojenik escherichia coli kökenlerinin araştırılması*
Küçük Resim Yok
Tarih
2015
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Escherichia colinin bazı serogrup ve serotiplerinin gastroenterit etiyolojisindeki rolü her geçen gün daha iyi anlaşılmaktadır. Patojen E.coli kökenlerini normal bağırsak flora elemanlarından ayıran virülans faktörlerinin tespiti, hastalığın tanı ve tedavisi açısından önem taşımaktadır. Bu çalışmada, gastroenterite yol açan E.coli kökenlerinin serotiplendirilmesi ve virülans genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Şubat-Ekim 2009 tarihleri arasında Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi, Sağlık Araştırma ve Uygulama Hastanesi kliniklerine ishal şikayeti ile başvuran hastalardan alınarak Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen sulu, kanlı veya mukuslu 202 dışkı örneği dahil edilmiştir. Örneklerde baskın olarak üreyen ve konvansiyonel yöntemlerle tanımlanan toplam 254 E.coli kökeni, enteropatojenik E.coli (EPEC), enterotoksijenik E.coli (ETEC) ve enteroinvazif E.coli (EIEC)ye ait O serogruplarını içeren 6 adet polivalan antiserum kullanılarak lam aglütinasyonu (LA) ile taranmıştır. Serolojik yöntemle pozitif sonuç veren örnekler ile kontrol olarak negatifler arasından haritalama metodu ile seçilen aynı sayıda dışkı örneği, EPEC, ETEC ve EİECye ait virülans genler- inin varlığı açısından konvansiyonel PCR yöntemi ile araştırılmıştır. Çalışmamızda, örneklerin %14.3ü (29/202) LA ile serogruplandırılmış; bunların 13 (%6.4)ü EPEC, 11 (%5.4)i EIEC ve 5 (%2.4)i ETEC olarak tanımlanmıştır. Monovalan antiserumlar ile EPEC serogrubundaki beş bakterinin tiplendirilmesi yapılabilmiş ve bu kökenlerin O1 serogrubunda olduğu tespit edilmiştir. Serogruplandırılan 29 patojen E.coliden 3 (%10.3)ünde diyarejenik suşlara ait virülans genleri saptanmıştır. Bir izolat EPECe ait eaeA geni pozitif bulunmasına rağmen, bfpA ve stx geni içermediğinden atipik EPEC olarak tanımlanmıştır.Diğer iki örnekten birinde ETECe ait estA geni, diğerinde ise EIECe ait ial geni pozitif bulunmuştur. EPEC olarak serogruplandırılan bir kökenin PCR ile ETECe ait estA genini taşıdığı gösterilmiştir. Polivalan antiserumlarla negatif sonuç veren 29 kontrol suşunun hiçbirisinde virülans geni saptanmamıştır. Sonuç olarak, patojen E.coli kökenlerinin tanımlanmasında serogruplandırma ve klasik PCR yöntemlerinin ben- zer sonuçları vermediği izlenmiş; bu amaçla çok merkezli ve çok sayıda örneğin standardize yöntemlerle incelendiği ileri çalışmalara gereksinim olduğu kanısına varılmıştır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Kaynak
Mikrobiyoloji Bülteni
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
49
Sayı
1
