Molecular Identification of Diplodia Seriata De Not. Causing Dieback Effect on Grapevines and Evaluation of in Vitro Efficacy of Five Different Synthetic Fungicides Against This Disease

Simple item page
dc.contributor.authorGüngör Savaş, Nurdan
dc.contributor.authorYıldız, Murat
dc.date.accessioned2021-11-20T10:39:02Z
dc.date.available2021-11-20T10:39:02Z
dc.date.issued2021
dc.departmentTrakya Üniversitesien_US
dc.description.abstractThe aim of this study was to realize the molecular identification of Diplodia seriata De Not., a member of the Botryosphaericea family, isolated from 2-10 years old vines in vineyards showing symptoms of dieback disease. The susceptibility of the pathogen against the fungicides with the fosetyl-Al+triadimenol, azoxystorbin+difecanozole, fludioxanil+cyprodinil, metrafenone, fluopyram+tebuconazole combinations were evaluated. The isolates obtained from the root and crown parts of the vine samples were identified as D. seriata according to the morphological and molecular methods. In molecular identification, the ITS (Internal Transcribed Spacer) and TUB2 (?-tubulin) gene regions of the isolates were amplified by Real-Time PCR and the nucleotide sequences were obtained in these gene regions. After using the MEGA 7 software, ITS and TUB2 sequences were aligned and a combined phylogenetic tree was made. It has been molecularly confirmed that the D. seriata isolate has a 100% similarity index with Diplodia species according to the phylogenetic analyses. The mean effective concentration (EC50) values of fungicides used with different concentrations (0, 1, 3, 10, 30, 50, 100 ?L mL-1) were determined by Probit analysis. Cyprodinil + fludioxonil showed the highest efficacy (100%) at a concentration of 1 ?L mL-1. According to EC50 values, cyprodinil + fludioxonil (0.001 ?L mL-1) was recorded as the most effective fungicide followed by fluopyram + tebuconazole (0.520 ?L mL-1) and, azoxystrobin + difenoconazole (2.958 ?L mL-1), respectively.en_US
dc.description.abstractBu çalışmanın amacı, geriye doğru ölüm hastalığı belirtileri gösteren bağlardaki 2-10 yaşındaki asmalardan izole edilen Botryosphaericea ailesinin bir üyesi olan Diplodia seriata De Not.'nın, moleküler tanılamasını gerçekleştirmektir. Patojenin duyarlılığı, fosetil-Al+triadimenol, azoxystorbin+difecanozole, fludioxanil+cyprodinil, metrafenon, fluopyram+tebuconazole dâhil olmak üzere çeşitli fungisitlere karşı değerlendirilmiştir. Üreticiler tarafından getirilen asma örneklerinin kök ve kök boğazı kısımlarından elde edilen izolatlar, morfolojik ve moleküler yöntemlere göre D. seriata olarak tanımlanmıştır. Moleküler tanımlamada izolatların ITS (Internal Transcribed Spacer) ve TUB2 (?-tubulin) gen bölgeleri Real-Time PCR ile çoğaltılmış ve bu gen bölgelerinden nükleotid dizileri elde edilmiştir. Daha sonra MEGA 7 yazılımı kullanılarak ITS ve TUB2 dizileri hizalanmış ve kombine bir filogenetik ağaç çizilmiştir. Diplodia seriata izolatının filogenetik analizlere göre Diplodia türleri ile % 100 benzerlik indeksine sahip olduğu moleküler olarak doğrulanmıştır. Farklı konsantrasyonlarda (0, 1, 3, 10, 30, 50, 100 ?L mL-1) kullanılan fungisitlerin ortalama etkili konsantrasyon (EC50) değerleri Probit analiziyle belirlenmiştir. Cyprodinil+fludioxonil 1 ?L mL-1 konsantrasyonunda en yüksek etkinliği (%100) göstermiştir. EC50 değerlerine göre cyprodinil+fludioxonil (0.001 ?L mL-1) en etkili fungisit olarak kaydedilmiş, ardından fluopyram+tebuconazole (0.520 ?L mL-1) ve azoxystrobin+difenokonazol (2.958 ?L mL-1) izlemiştir.en_US
dc.identifier.dergipark863506en_US
dc.identifier.doi10.23902/trkjnat.863506en_US
dc.identifier.endpage100en_US
dc.identifier.issn2147-0294
dc.identifier.issn2528-9691
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage93en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.23902/trkjnat.863506
dc.identifier.urihttps://dergipark.org.tr/tr/pub/trkjnat/issue/61393/863506
dc.identifier.urihttps://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/1517497
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14551/7574
dc.identifier.volume22en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisherTrakya Üniversitesien_US
dc.relation.ispartofTrakya University Journal of Natural Sciencesen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Başka Kurum Yazarıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.snmz20240608_ID_Qen_US
dc.subjectBotryosphaericeaen_US
dc.subjectDiebacken_US
dc.subjectDiplodia seriataen_US
dc.subjectVitis viniferaen_US
dc.titleMolecular Identification of Diplodia Seriata De Not. Causing Dieback Effect on Grapevines and Evaluation of in Vitro Efficacy of Five Different Synthetic Fungicides Against This Diseaseen_US
dc.typeArticleen_US

Files

Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
7574.pdf
Size:
906.73 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Tam Metin / Full Text
Download

Collections

Trakya University Journal of Natural Sciences
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu