Allele Frequency of Glutenin Subunits and Glu-1 Quality Scores in Some Turkish Bread Wheat Landraces
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2020
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Trakya Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
There are eight centers of origin for cultivated plants andTurkey is located in the interception of two of these centers, the Near Eastand the Mediterranean. Therefore, Turkey is known to be the gene center for diversificationand dispersion of such main cereal crops such as wheat, barley, rye and oat.This study was performed to determine glutenin gene allele frequencies and Glu-1 quality scores of 116 local wheatlandraces of Turkish bread wheat. SDS-PAGE and PCR were used to identifyglutenin gene alleles. The results showed that the studied Turkish local wheatlandraces contained a total of 19 different subunits (3 subunits in Glu-A1, 11 in Glu-B1 and 5 in Glu-D1)with 50 different combinations. The highest and the lowest allelic combinationswere determined in East Anatolia and the Aegean regions, respectively. Glu-A1c (65.11%), Glu-B1b (53.60%) and Glu-D1a(58.30%) were the most frequent alleles. The Glu-1 quality score was found to be 6.07 for the studied genotypes.Among the regions, the highest (7.18) and the lowest (4.80) mean Glu-1 scores were detected in Marmaraand Southeastern Anatolia regions, respectively. 4 accessions (TR32846-6, TR36948-1, TR45105 and TR63536) were reportedto have the highest Glu-1 quality score as 10. 6 genotypes (TR45398-4,TR48025-3, TR33264-6, TR393-5, TR52021-3 and TR45094) had the quality score of9. Including more new landraces may contribute to discover new Glu-1alleles.
Kültürbitkileri için sekiz orijin merkezi vardır ve Türkiye, bu merkezlerdenikisinin, Yakın Doğu ve Akdeniz'in, kesiştiği yerdedir. Türkiye bu nedenlebuğday, arpa, çavdar ve yulaf gibi ana tahıl bitkilerinin çeşitlendiği vedağıldığı gen merkezi olarak bilinir. Bu çalışmanın amacı, Türk ekmeklikbuğdaylarından 116 yerel buğday ırkının glüten allel sıklığı ve Glu-1 kalite skorunu belirlemektir.SDS-PAGE ve PCR, glüten allellerini tanımlamak için kullanılmıştır.İstatistiksel analizler için POPGENE 1.31 yazılımı kullanılmıştır. İncelenenTürk yerel buğday ırkları toplam 19 farklı alt birim (Glu-A1'de 3 alt birim, Glu-B1'de11 ve Glu-D1'de 5 alt birim) ve 50farklı kombinasyon içermektedir. En yüksek ve en düşük allel kombinasyonlarısırasıyla Doğu Anadolu ve Ege bölgelerinde belirlenmiştir. Glu-A1c (% 65,11), Glu-B1b(% 53,60) ve Glu-D1a (% 58,30) en sıkgörülen alleller olarak tespit edilmiştir. Glu-1kalite skoru, Türkiye genelinde incelenen genotipler için 6,07 olarakbulunmuştur. Bölgeler arasında ortalama en yüksek (7,18) ve en düşük (4,80) Glu-1 skorları sırasıyla Marmara veGüneydoğu Anadolu bölgelerinde tespit edilmiştir. Çalışılan 116 aksesyondan 4tanesi (TR32846-6, TR36948-1, TR45105 ve TR63536) kalite skoru 10 olup enyüksek Glu-1 kalite skoruna sahipken6 tanesinin ise (TR45398-4, TR48025-3, TR33264-6, TR393-5, TR52021-3 veTR45094) kalite skoru 9 olarak hesaplanmıştır. Daha fazla yerel çeşitlerinçalışmalara eklenmesi yeni Glu-1 allelerininkeşfedilmesine katkıda bulunabilir.
Kültürbitkileri için sekiz orijin merkezi vardır ve Türkiye, bu merkezlerdenikisinin, Yakın Doğu ve Akdeniz'in, kesiştiği yerdedir. Türkiye bu nedenlebuğday, arpa, çavdar ve yulaf gibi ana tahıl bitkilerinin çeşitlendiği vedağıldığı gen merkezi olarak bilinir. Bu çalışmanın amacı, Türk ekmeklikbuğdaylarından 116 yerel buğday ırkının glüten allel sıklığı ve Glu-1 kalite skorunu belirlemektir.SDS-PAGE ve PCR, glüten allellerini tanımlamak için kullanılmıştır.İstatistiksel analizler için POPGENE 1.31 yazılımı kullanılmıştır. İncelenenTürk yerel buğday ırkları toplam 19 farklı alt birim (Glu-A1'de 3 alt birim, Glu-B1'de11 ve Glu-D1'de 5 alt birim) ve 50farklı kombinasyon içermektedir. En yüksek ve en düşük allel kombinasyonlarısırasıyla Doğu Anadolu ve Ege bölgelerinde belirlenmiştir. Glu-A1c (% 65,11), Glu-B1b(% 53,60) ve Glu-D1a (% 58,30) en sıkgörülen alleller olarak tespit edilmiştir. Glu-1kalite skoru, Türkiye genelinde incelenen genotipler için 6,07 olarakbulunmuştur. Bölgeler arasında ortalama en yüksek (7,18) ve en düşük (4,80) Glu-1 skorları sırasıyla Marmara veGüneydoğu Anadolu bölgelerinde tespit edilmiştir. Çalışılan 116 aksesyondan 4tanesi (TR32846-6, TR36948-1, TR45105 ve TR63536) kalite skoru 10 olup enyüksek Glu-1 kalite skoruna sahipken6 tanesinin ise (TR45398-4, TR48025-3, TR33264-6, TR393-5, TR52021-3 veTR45094) kalite skoru 9 olarak hesaplanmıştır. Daha fazla yerel çeşitlerinçalışmalara eklenmesi yeni Glu-1 allelerininkeşfedilmesine katkıda bulunabilir.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Gluten Allele frequency, Allele frequency, Glu-1 quality score, Turkish bread wheat landraces
Kaynak
Trakya University Journal of Natural Sciences
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
21
Sayı
1
