Trakya Bölgesi'ndeki Giardia intestinalis İzolatlarının Genotiplendirilmesi
| dc.contributor.author | Çiçek, Cemal | |
| dc.contributor.author | Şakru, Nermin | |
| dc.date.accessioned | 2024-06-12T10:14:12Z | |
| dc.date.available | 2024-06-12T10:14:12Z | |
| dc.date.issued | 2015 | |
| dc.department | Trakya Üniversitesi | en_US |
| dc.description.abstract | Giardia intestinalis su ve gıda kaynaklı salgınlara neden olabilen, insanlarda sık görülen bir protozoondur. Dünyada ve Türkiye'de önemli bir halk sağlığı sorunu oluşturmaktadır. G.intestinalis'in epidemiyolojisi, genetik popülasyonu ve taksonomisini belirlemede moleküler teknikler yaygın olarak kullanılmaktadır. G.intestinalis'in insanlarda genotip A ve genotip B olmak üzere iki genotipi bulunmaktadır. Bu çalışmanın amacı; insanlardan elde edilen G.intestinalis izolatlarının moleküler yöntemlerle analizidir. Çalışmaya, Eylül 2011-Nisan 2013 tarihleri arasında, Trakya Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi ve Edirne Devlet Hastanesine başvuran kişilerin (30 erkek, 9 kadın; yaş aralığı: 1-74 yıl, ortanca yaş: 20) dışkılarından elde edilen 39 izolat alınmıştır. Hem nativ hem de lugol yöntemiyle mikroskobik olarak incelenen her örnekte, x400'lük büyütmede en az 50 alan taranarak ortalama kist sayısı saptanmıştır. Daha sonra örnekler, ilmiğe dayalı izotermal çoğaltma yöntemi (LAMP) ile uzama faktörü-1 alfa (EF-1?) gen bölgesi ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile de beta-giardin (bg) gen bölgesinin varlığı yönünden analiz edilmiş; ayrıca bg geninin dizi analizi yapılmıştır. Otuz dokuz örneğin 32'sinde (%82) LAMP yöntemiyle, 19'unda ise (%48.7) PCR ile, sırasıyla EF-1? ve bg pozitifl iği saptanmıştır. Genotiplendirmenin yapılabildiği 17 örneğin dokuzu genotip A, sekizi genotip B olarak belirlenmiş; alt genotipler olarak A2 (n= 6), A3 (n= 3), B2 (n= 6), B3 (n= 1) ve B4 (n= 1) tanımlanmıştır. Semptomatik 21 olgunun tiplendirilebilen sekiz izolatında genotip B (n= 5)'nin, asemptomatik 18 olgunun tiplendirilebilen dokuz izolatında ise genotip A (n= 6)'nın daha fazla görüldüğü izlenmiştir. Semptomatik ya da asemptomatik olgular arasında genotipler açısından istatistiksel olarak anlamlı fark saptanmamıştır (p= 0.347). PCR pozitifl ik oranı, kist yoğunluğu yüksek ve düşük olan olgular arasında anlamlı fark göstermiştir (p= 0.0001). Sonuç olarak, LAMP ve PCR gibi moleküler yöntemlerin kullanılması, ortaya çıkabilecek salgınların analizinde yol gösterici olacaktır. Ayrıca bölgemizdeki G.intestinalis alt tip tanımlamasının, global epidemiyolojik verilere katkıda bulunacağı düşünülmektedir | en_US |
| dc.identifier.endpage | 585 | en_US |
| dc.identifier.issn | 0374-9096 | |
| dc.identifier.issue | 4 | en_US |
| dc.identifier.startpage | 576 | en_US |
| dc.identifier.trdizinid | 195288 | en_US] |
| dc.identifier.uri | https://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/195288 | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.14551/14498 | |
| dc.identifier.volume | 49 | en_US |
| dc.indekslendigikaynak | TR-Dizin | en_US |
| dc.language.iso | tr | en_US |
| dc.relation.ispartof | Mikrobiyoloji Bülteni | en_US |
| dc.relation.publicationcategory | Makale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı | en_US |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | en_US |
| dc.title | Trakya Bölgesi'ndeki Giardia intestinalis İzolatlarının Genotiplendirilmesi | en_US |
| dc.type | Article | en_US |
